SARS CoV-2，一种特殊的冠状病毒

自2019年12月出现首例冠状病毒病病例以来，这种大流行性疾病已蔓延至全球数百万人。这场新型冠状病毒的全球大流行严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）是当今最引人注目、最令人担忧的全球卫生危机之一，对世界构成巨大威胁，影响人类生活的各个方面。[1]
冠状病毒是冠状病毒科的一类有包膜的单链正义RNA病毒，其宿主范围广泛，包括人类、蝙蝠、骆驼和禽类，以及家畜和伴侣动物，对公众健康构成威胁。¹ 冠状病毒属于正冠状病毒亚科，该亚科根据蛋白质序列的差异进一步分为四个属：α冠状病毒属、β冠状病毒属、γ冠状病毒属和δ冠状病毒属。α冠状病毒属和β冠状病毒属仅感染哺乳动物，而γ冠状病毒属和δ冠状病毒属主要感染鸟类，但其中一些也能感染哺乳动物。HCoV-229E，

目前已知的可感染人类的​​冠状病毒有七种：ωV-OC43、HCoV-NL63、HCoV-HKU1、SARS-CoV、MERS-CoV 和 SARS-CoV-2。其中，SARS-CoV 和 MERS-CoV 分别于 2002 年和 2012 年在人群中出现，具有高度致病性。而目前在人群中传播的人类冠状病毒 (HCoV)-229E、HCoV-NL63、HCoV-OC43 或 HCoV-HKU1 毒株仅引起普通感冒。严重急性呼吸综合征冠状病毒 2 (SARS-CoV-2) 是 COVID-19 的病原体，是一种新型冠状病毒，于 2019 年底出现，并已造成大量死亡。新冠肺炎与SARS-CoV和MERS-CoV的症状相似：发热、疲倦、干咳、上胸痛，有时伴有腹泻和呼吸困难。与以往不同的是冠状病毒（CoV）感染SARS-CoV-2 的快速全球传播、高传播率、较长的潜伏期、更多无症状感染以及疾病严重性，要求我们深入了解病毒的免疫逃避策略。

与其他人类冠状病毒（SARS-CoV-2、MERS-CoV）一样，SARS-CoV-2 也具有约 30 kb 大小的单链正义 RNA 基因组。如图 1 所示，病毒核衣壳 (N) 蛋白将基因组包裹成一个大型核糖核蛋白 (RNP) 复合物，然后该复合物被脂质和病毒蛋白 S（刺突蛋白）、M（膜蛋白）和 E（包膜蛋白）包裹。基因组5'端有两个大的开放阅读框（ORF），即ORF1a和ORF1b，分别编码多肽pp1a和pp1b。这些多肽经病毒蛋白酶NSP3和NSP5加工后，生成16种非结构蛋白（NSP），参与病毒复制的各个环节。NSP3和NSP5分别含有木瓜蛋白酶样结构域和3C样蛋白酶结构域。⁹ 基因组3'端编码结构蛋白和辅助蛋白，其中ORF3a、ORF6、ORF7a和ORF7b已被证实是参与病毒颗粒形成的病毒结构蛋白，而ORF3b和ORF6则具有干扰素拮抗剂的功能。根据目前基于与其他β冠状病毒序列相似性的注释，SARS-CoV-2包含六种辅助蛋白（3a、6、7a、7b、8和10）。然而，并非所有这些开放阅读框都经过实验验证，SARS-CoV-2 的辅助基因的确切数量仍存在争议。因此，目前尚不清楚这种紧凑型基因组究竟表达了哪些辅助基因。[2]
高灵敏度和高特异性的检测对于识别和管理新冠肺炎患者以及实施控制措施以限制疫情爆发至关重要。与基于实验室的诊断方法相比，即时分子检测（POC）有望更早地发现和隔离确诊的SARS-CoV-2病例，从而减少家庭和社区传播。
[1]急诊科快速床旁SARS-CoV-2检测的临床和运营影响
[2] 宿主与SARS-CoV-2的斗争：先天免疫和病毒逃逸策略